Järjestelmän kunnostamisesta voidaan myöntää poikkeus, jos kiinteistöllä muodostuvan jätevesien määrä on huomattavan pieni tai kunnostamiskustannukset ovat kohtuuttomia kiinteistön omistajalle. Lupa voidaan myöntää enintään viideksi vuodeksi.
Mahdollisuus hakea lupaa poiketa käsittelyvaatimuksista koskee ainoastaan niitä kiinteistöjä, joita siirtymäaika koskee.
Hakemuksen käsittelystä peritään Raaseporin ympäristönsuojeluviranomaisen taksan mukainen maksu.